學院院系
基礎醫學院
- 生理學與病理生理學系
- 生物化學與生物物理學系
- 人體解剖學與組織胚胎學系
- 藥理學系
- 免疫學系
- 病理學系
- 病原生物學系
- 神經生物學系
- 細胞生物學系
- 醫學遺傳學系
- 醫學生物信息學系
- 放射醫學系
- 北京大學系统生物医学研究所
- 心血管所
- 中西醫結合教研室
- 醫學實驗教學中心
藥學院
- 化學生物學系
- 藥物化學系
- 天然藥物學系
- 藥劑學系
- 分子与细胞藥理學系
- 藥事管理與臨床藥學系
- 天然藥物及仿生藥物國家重點實驗室
- 藥學實驗教學中心
- 應用藥物研究所
- 中國藥學（英文版）編輯部
公共衛生學院
- 流行病與衛生統計學系
- 勞動衛生與環境衛生學系
- 營養與食品衛生學系
- 婦幼衛生學系
- 毒理學系
- 衛生政策與管理學系
- 社會醫學與健康教育系
- 衛生檢驗學系
- 全球衛生學系
- 生物統計系
- 北京大學儿童青少年卫生研究所
- 北京大學生育健康研究所
- 衛生部生育健康重點實驗室
- 循證醫學中心
- 艾滋病預防研究中心
- 營養與保健食品評價中心
- 预防醫學實驗教學中心
- 北京大學应急管理中心
- 老年健康服務研究中心
醫學人文學院
- 醫學史與醫學哲學系
- 醫學倫理與法律學系
- 醫學心理學系
- 醫學語言文化系
- 健康政治學系/馬克思主義理論教研中心
- 體育與健康系
- 健康信息管理系
- 美學與藝術教育中心
- 研究中心
醫學繼續教育學院
- 北京大學醫學繼續教育學院组建于2017年5月，由原北京大學医学网络教育学院（成立于2000年）和原7k网彩票在职教育培训中心（成立于2002年）整合而成，是北京大學开展医学繼續教育与培训的重要平台，与本科生教育、研究生教育相呼应，共同构成“北大医学”人才培养体系，肩负服务于医疗健康行业、服务于医学终身教育体系、服务于全社会的时代重任。
