- 北京大學第四临床医学院 （北京積水潭醫院）
- 北京大學第五临床医学院 （衛生部北京醫院）
- 北京大學中日友好临床医学院 （衛生部中日友好醫院）
- 北京大學第九临床医学院 （北京世紀壇醫院）
- 北京大學航天临床医学院 （北京航天中心醫院）
- 北京大學民航临床医学院 （民航總醫院）
- 北京大學回龙观临床医学院 （北京回龍觀醫院）
- 北京大學中医药临床医学院（西苑） （中國中醫科學院西苑醫院）
- 北京大學三〇二临床医学院 （解放軍總醫院第五醫學中心)
- 北京地坛医院教學醫院 （北京地壇醫院）
- 北京大學首都儿科研究所教學醫院 （首都兒科研究所）
- 北京大學北京京煤集团总医院教學醫院 （北京京煤集團總醫院)
- 北京大學北京仁和医院教學醫院 （北京仁和醫院）
- 北京大學解放军三〇六医院教學醫院 （戰略支援部隊特色醫學中心）
