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- 北京大學第五临床医学院 (衛生部北京醫院)
- 北京大學中日友好临床医学院 (衛生部中日友好醫院)
- 北京大學第九临床医学院 (北京世紀壇醫院)
- 北京大學航天临床医学院 (北京航天中心醫院)
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- 北京大學回龙观临床医学院 (北京回龍觀醫院)
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- 北京大學北京京煤集团总医院教學醫院 (北京京煤集團總醫院)
- 北京大學北京仁和医院教學醫院 (北京仁和醫院)
- 北京大學解放军三〇六医院教學醫院 (戰略支援部隊特色醫學中心)
- 北京大學海淀医院教學醫院(北京市海淀医院/北京大學第三医院海淀院区)